Le Syndicat mixte du Pays de l’Isle en Périgord est de type « fermé », c’est-à-dire qu’il ne regroupe en son sein que des EPCI (Etablissement Public de Coopération Intercommunale) : Communauté d’Agglomération ou Communautés de communes.

Les choix de missions et les décisions, sont pris à l’intérieur d’une instance délibérante appelée « Comité syndical ». Cette instance compte au total 51 membres issus des 4 EPCI.

Une instance restreinte, appelée « Bureau », constituée de 19 membres, peut se réunir pour échanger d’orientations ou projets à proposer au Comité syndical. Les membres du Bureau sont issus du Comité syndical.